Территория современного города Перми заселена человеком с каменного века. В городе изучены более 130 археологических памятников. Территория, на которой сейчас расположена Пермь, в XVII веке принадлежала Строгановым. Первые документальные упоминания о поселениях на территории Перми встречаются в переписных книгах воеводы Прокопия Елизарова в 1647 году. Там упоминается починок на реке Ягоши?ха (теперь Егоши?ха). Согласно переписи 1678 года, в деревне Егоши?ха насчитывалось семь 
дворов и проживало «28 душ мужского пола, в основном фамилии Брюхановых, Верхоланцевых и Федотовых».
В начале XVIII века началось активное освоение месторождений полезных ископаемых Урала. 9(20) марта 1720 года по приказу Петра I капитан-поручик артиллерии Василий Никитич Татищев, управляющий Уральскими казёнными заводами, известный русский историк и географ, отправился в Сибирскую губернию для постройки заводов по выплавке меди и серебра. Татищев выбрал для постройки медеплавильного завода место около деревни Егошиха (вблизи устья реки Егошихи, впадающей в Каму) благодаря наличию медной руды и удобному положению для вывоза продукции.
В 1721 году Татищев был отозван, а его преемником назначен генерал-майор артиллерии Георг Вильгельм (Вилим Иванович) де Геннин. Де Геннин одобрил проект Татищева и в 1722 году распорядился о подготовке к строительству завода. Днём основания города Перми считается начало строительства Егошихинского (Ягошихинского) медеплавильного завода — 4(15) мая 1723 года. При закладки завода присутствовал Н. В. Татищев. Строительство завода велось под руководством Татищева и де Геннина. В 1734 году посёлок Егошихинский завод стал административным центром Пермского горного округа. В 1738 году в 4 верстах от Егошихинского завода был запущен Мотовилихинский медеплавильный завод. В 1727 году Соликамская провинция с городами Чердынью и Кунгуром и Егошихинским заводом вошла в состав Казанской губернии под именем Пермской провинции. Егошихинский завод вместе с рабочим посёлком при нём сформировался как город и выполнял соответствующие функции ещё до официального признания. 20 ноября (1 декабря) 1780 года Екатерина II подписала указ о создании на основе завода города Перми и Пермского наместничества в составе двух областей — 
Пермской и Тобольской:
«Учтя… выгодность положения Ягошихинского завода и способность места сего для учреждения в нем губернского города… предписываем вам город губернский для Пермского наместничества, назначить в сем месте, наименовав оный город Пермь.» Наместником был назначен генерал-поручик Евгений Петрович Кашкин. В 1780—1781 годах велась постройка зданий для официальных учреждений, заложены Казанский и Сибирский тракты (сейчас улицы Ленина и Сибирская). Открытие города и наместничества состоялось 18(29) октября 1781 года. 17 июля 1783 года был утверждён герб города Перми: в красном поле серебряный крест, означающий первое — дикость нравов обитавших жителей, а второе — просвещение через принятия христианского закона. В 1788 году Егошихинский завод был закрыт в связи с истощением месторождений. Пермь стала развиваться как административный, торгово-транспортный и культурный центр Урала. В соответствии с указом императора Павла I от 12 декабря 1796 года «О новом разделении государства на губернии» Пермское наместничество было преобразовано в Пермскую губернию с центром в Перми. Губернатором был назначен Карл Фёдорович Модерах. Среди прочих его заслуг историками отмечается разработанная им правильная планировка улиц Перми. Строительный план К. Ф. Модераха осуществлялся в течение всего XIX века. В 1840 году британский геолог сэр Родерик Мурчисон, исследуя обширные выходы геологических пластов в окрестностях Перми, открыл Пермский геологический период, получивший название в честь города. В 1863 году из-за истощения руд Мотовилихинский завод был закрыт, и в том же году ниже по течению Камы были заложены Пермские пушечные заводы. Железнодорожный мост через Каму в Перми. Фото С. М. Прокудина-Горского, 191024 августа 1878 года состоялось открытие Уральской железной дороги от Перми до Чусовой. Конец XIX в. стал в Перми периодом грандиозного железнодорожного строительства. Еще в 1874—1878 годы была введена в строй линия Пермь — Кушва — Екатеринбург. В 1897—1898 годах была проложена Пермь-Котлаская ветка, соединившая 
Уральскую железную дорогу с железнодорожной сетью Европейской России.
В конце XIX века в Перми активно развивались учреждения искусства и культуры. В 1874 году началось строительство театра оперы и балета. Осенью 1879 года там была поставлена опера «Русалка» А. С. Даргомыжского. В 1886 году был открыт первый кинотеатр — «Иллюзион». Он находился на углу улицы Пушкина и Комсомольского проспекта.
В октябре 1905 года на Мотовилихинском заводе был сформирован Совет рабочих депутатов. 12—13 декабря произошло восстание рабочих, которые вели баррикадные бои с царскими войсками. Восстание было жестоко подавлено.
В 1910 году Пермь посетил Сергей Михайлович Прокудин-Горский, известный русский фотограф, разработавший метод создания цветных диапозитивов по методу трёхцветной фотографии, который в 1909—1915 годах по поручению императора Николая II совершал путешествие с целью запечатлеть в цветных фотографиях современную ему Россию, её культуру, историю и модернизацию. В коллекции его фотографий, опубликованной на сайте Библиотеки Конгресса США, ножно найти 12 фотографий, сделанных в Перми (из них 10 — цветные) и 3 фотографии, сделанных в Пермском крае. 17 декабря 1917 года I губернский съезд Советов рабочих и солдатских депутатов провозгласил в Пермской губернии Советскую власть. 3 ноября 1927 года состоялось объединение Перми и рабочего поселка Мотовилиха в один город. В 1931—1938 годах Мотовилиха имела статус самостоятельного города Молотово. В 1930 году началось строительство моторостроительного завода № 19 (позднее — завод им. Сталина, завод им. Свердлова, 
ныне — Пермский моторостроительный комплекс).
Памятник героям фронта и тылаС 1940 по 1957 город назывался Молотов в честь политического деятеля и председателя правительства СССР в 1930—1941 гг В.М. Молотова. В 1955 году закончилось сооружение Камской гидроэлектростанции. В 1958 году введена в эксплуатацию первая очередь Пермского нефтеперерабатывающего завода (ныне — ООО «ЛУКойл-Пермнефтеоргсинтез»).
В 1967 году был построен коммунальный автодорожный мост через Каму. 22 января 1971 года город Пермь награждён орденом Ленина за успешное выполнение пятилетнего плана по развитию промышленного производства. 20 марта 1994 года произошли первые в постсоветской истории выборы в Пермскую городскую Думу.
